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SNP芯片数据分析

1， 芯片原始数据的处理和基因分型，有统计意义的SNP列表， 描述性统计，如minor allele frequency，Hardy-Weinberg equilibrium等。
显著性检验，实验组与对照组的差异，假阳性率（FDR）的计算等， SNP的关联分析，建立线性模型或logistic回归模型等。(所有的统计可以选择由SAS，SPSS，或S-Plus/R给出)。

2，CNV计算分析。

3，SNP相关基因的功能注释。

4，SNP数据与其他高通量数据整合。

表达谱基因芯片数据分析

1，统计分析。

2，差异基因筛选。

3，功能分类。

4，聚类分析。

5，通路分析。

 

甲基化芯片、外显子芯片等数据分析